智者文明与乐者文明、行者文明、舞者文明并列，是大逃亡时期诞生的四个古文明，与“一神论”的秩序时期的单一某神有着即答关联。
舞者文明的概念：涅槃，火焰，不灭的首都，舞者文明的首领将在“公约感官”的转化下成为一个中华风装扮的女皇。
3、塔最开始设定为一个居住在下水道的原始人（相较于现代经由手术和改造的人而言），是个流浪汉，Ena将在逃脱追捕的过程中与她相遇，她的巢穴帮助Ena躲掉了追捕，但Ena表示作为地球的一员她必须要找到公约同盟的基地并自首——在一开始的设定里，地球便是公约同盟的一分子。而塔因为对宇宙旅行充满向往，请求Ena带她离开地球，否则她就向人文派举报Ena。
4、最开始，Ena并不是自主前往公约同盟的基地，而是像被押送罪犯一样押送至基地，而途中遭到了“人文派”的伏击，她为了躲避人文派的追捕而四处逃窜。
5、“人文派”最开始也具有“宇宙诸多政府联合的组织”的性质，但现在在新设定里，“人文派”更像是一个民间联合组织、一个精英派对。
6、Ake最开始的设定是公约同盟具有雇佣性质的杀手，他的血液可塑型的能力并非天生，而是经由疯狂科学家的改造，为了自由，他杀了那个科学家逃走了，一直过着自由杀手的生活，直到他得知了人文派的疯狂实验，他厌恶没有人性的科学，反对科学造神，因此他成为了一个双面间谍
7、最开始Ena的设定是半机械半人造人，因此她似人又非人，但在最终设定里她成为了纯粹的科技造物，脱离了通常范畴的生物概念。
8、在一开始的构思中，Ena并不是因为被病毒侵入系统而成为神，而是因为获得了一种叫做“锁”的未知物质，因为拥有了这个未知物质，Ena被认作是危险的存在而被押送至公约同盟接受手术摘除，而人文派同时也想获得这个物质
9、在“天堂”外围，Ena本将遭遇一场“尸潮”，这些尸体形成的丧尸型怪物便是人文派实验失败的产物，Ena在那里被一群丧尸追杀，并将在那里遇到N，N的设定最开始只是一个身份未知的绅士，实际上是类似梦魇的存在，他目睹了人文派那些丧心病狂的实验，并告诉Ena通往“天堂”建筑内部的道路。但在目前的剧情中，N被赋予了另一种含义。
接上，Ena在这场“尸潮”中将解救一对母女，女儿是患有自闭症的小画家，母亲则是有些偏执的科学家，母亲为了保护女儿，在最后会牺牲自己，而女儿的画作中将暗示Ena最终的敌人。
10、Ena的最终敌人将是一个人造人，她模样美丽，是人文派完美的造物，她是用巨量“锁”打造的，但是“锁”的量还不够，而Ena身上的“锁”将补全，Ena会与Ake合作击败她，但是最后物质会如同病毒一样蔓延到Ena身上，使Ena成为了那个神。
在这一设定里，公约同盟没拥有足够多的“锁”
，因此比人文派被动，他们会全力阻挠
人文派的“锁”的来源，并意图抢夺走人文派所创造的那个完美的人造神
11、在一开始，并没有“这是一个二元论的时代、一个二神对立的矛盾时代、一个属于人的时代、一个科学崇拜与个人主义盛行的时代”等这些设定，也没有“发展的三阶段”这个阶段式设定，Ena最终将成为宇宙唯一真理的具现，为世界带来末日，而她的同伴们都会被她杀死。
11、在一开始，Ake就是人文派的间谍，不过他的立场并不属于人文派，他希望“神”不要被世人创造出来，他在剧情中扮演的是弑神者。而不论是公约同盟还是人文派，他们都希望创造出神明
13、Greysia最开始的设定是行者文明的一员，行者文明以部落的形式分散存在，他们能够让自己短暂地变成凶悍的野兽，同时，她还有个姐姐叫White，在Ake将公约同盟及Ena背叛后，她死在了战场上，从而使基地没有被人文派侵占
Greysia在一开始的设定中是能变成狼，她本人在平时是狼耳娘的形象，但她用针线把自己的嘴巴缝上，并戴上了口罩，因为她曾在成人礼时化为野兽丧失理智（化为野兽是成人礼正常环节，但丧失理智不是），屠杀了一个部落的所有人，是White制服了她，让她恢复了理智。
12、Dyen最开始设定是冥葬文明的一员，冥葬文明的人以获取死亡的记忆为生，他们能用一个类似起雾器的东西重现已经消失的文明全貌和过去的记忆，但都只是幻象。冥葬文明依靠贩卖死亡的记忆发展，并且冥葬人有长生不老的能力。
Dyen来自一个贵族家族，他们家族负责做执刑人，负责定期杀掉一部分人控制文明人口，他有一个弟弟，但是Dyen天生缺乏情感感知，家里人又视他为接班人，对他严格，是母亲给予了他一点温暖，后来母亲因为压抑的家庭氛围去世，Dyen感到了悲伤，于是他杀死了家族中所有人，逃跑了。
但是Dyen的弟弟还活着，他立志要向哥哥复仇，他将在“尸潮”中与Dyen见面，并被Dyen杀死。
Ena将在一颗荒芜的星球上与Dyen见面，Dyen起先因为内疚于自己犯下的背叛家族之罪而不愿意离开，但Ake说服了他，他因此对Ake态度比较好。
在原先设定中，Dyen只是和Greysia一样沉默寡言，因此两人看起来合拍，并没有互相喜欢的设定
14、在构思的各种结局中，还有这样一个结局：Ena获得了大量的“锁”，但数量仍然不够，她于是前往了Ake的故乡，发现了大量怪物（乐者文明的人所变），在乐者文明毁灭之际，为了自救，他们把锁用在自己身上，这让他们获得了一些真理启示，赢得了永生，但也成了骇人的怪物
N在这里再次出现，并把Ena引入了怪物的陷阱，Ena被怪物袭击，来到乐者文明废址中心，获得剩余的一点足够的“锁”，成为神，N则声称这些怪物由他饲养，他负责欺骗无辜路人跌入陷阱，从而获得恐惧的情绪为食
在这个结局里，只有Dyen活了下来，塔、Greysia死于与人文派的人造神的战斗中，Ake与Ena合作后便离开，尚不知道他的下落
这一结局的构思是最为混乱的，即使在接受了一堆补足设定后，我仍然无法完善这个结局的细节上的逻辑，因此最终被我选择彻底删除不用，而有关Ena的设定也被我放置，并进行了更为漫长的修改过程
15、一开始便敲定了地球被毁灭的结局，不过最开始设定为地球是被人文派所彻底摧毁，并且并不在最终章节呈现，而是在开头Ena离开地球后便发生。
16、最开始Ena的监督者不是只有一个，而是三个，其中两个为一对夫妻，男方暗恋Ena并意图□□她，女方则为此与他大闹矛盾，最后他们因此没有选择作为Ena的监督者跟随着Ena离开，只有塔决心跟随